Gênero: Quebra-cabeça
Perspectiva: 1ª pessoa
Narrativa: Detetive / Mistério
Publicado por: Nintendo of America Inc
Desenvolvido por: Level-5 Inc
Lançado: 2007
Plataforma: Nintendo DS (NDS)
O professor Layton e seu aprendiz Luke recebem uma carta misteriosa. Descreve que Londres se tornou um lugar inóspito, inseguro e governado pelas forças do mal. A parte mais misteriosa da carta é aquela que se refere a tudo o que está acontecendo no futuro, não hoje, especificamente daqui a dez anos, e o autor da carta se revela como Lucas daqui a dez anos. Em seguida, o professor e seu aprendiz vão até o local mencionado na carta para descobrir o que está acontecendo e ajudar o Luke do futuro a salvar Londres da ameaça que paira sobre ele.
O professor Layton e seu aprendiz Luke vão até o local onde ele lhes envia uma carta enviada por Luke do futuro quando ele é dez anos mais velho, uma relojoaria quase abandonada. Sem saber como, de alguma forma eles viajam no tempo para o futuro: para Londres dentro de dez anos. Lá eles começam a investigar e a seguir o rastro do Luke do futuro.
Finalmente, quando o encontram, ele conta todos os detalhes do que aconteceu. Algumas semanas antes do presente, um cientista pouco conhecido convidou uma festa para as mentes mais brilhantes do mundo e os personagens mais conhecidos para apresentar sua própria invenção: uma máquina do tempo. Usando como voluntário o primeiro-ministro de Londres o inicia. Mas um imprevisto ocorre e, após a explosão, o primeiro-ministro e o cientista desaparecem deixando apenas pedaços da máquina. Após este evento, nas semanas seguintes cientistas de todo o mundo começaram a desaparecer e o professor Layton ficou obcecado com a ideia de construir uma máquina do tempo, ele usou sua inteligência e sua astúcia no submundo de Londres em negócios sujos que lhe renderam benefícios consideráveis. até que pouco a pouco tomou conta da cidade. Agora, na Londres daqui a dez anos, onde tudo isso aconteceu, o professor Layton, Luke e o Luke do futuro fazem todo o possível para atrapalhar os planos de Layton para o futuro. Enquanto investiga, Layton começa a suspeitar que a explosão da máquina do tempo na festa e aquela ocorrida há dez anos na qual sua namorada morreu estão relacionadas, já que ambos os casos surgiram da tentativa de operar uma máquina do tempo. Quando finalmente conseguem chegar até o professor Layton do futuro, o do presente acaba deduzindo que este é um impostor, e que na verdade é o cientista que produziu a explosão na atualidade, e que ainda seguia obcecado em experimentar com o tempo… Mas após repensar os acontecimentos, descobre-se que o Luke do futuro não passa de um impostor, e que a Londres do futuro em que se encontram nada mais é do que uma recreação subterrânea em uma gigantesca caverna. O verdadeiro Luke é um menino que perdeu os pais com a primeira explosão do passado, e desde então busca vingança por sua causa: o primeiro ministro, desde então se fez passar por amigo de Dimitri (o cientista) para cumprir seus próprios objetivos. : destruir Londres para que tudo comece de novo como deveria. O professor Layton, com a ajuda de seu arquiinimigo, Don Paolo e Celeste (a irmã mais nova de Claire, namorada falecida do professor), Luke e Flora o impedem. No final da história o falso Luke acaba sendo parado pela lei e seus planos desfeitos… E uma nova verdade é revelada: Dimitri estava tentando construir uma máquina do tempo para fazer Claire viver porque ela nunca morreu. Quando ocorreu a explosão mais antiga, a máquina que tentava operar foi eficaz e mandou Claire para o presente… mas aos poucos seu corpo luta para voltar ao momento em que ocorreu a explosão. Após essa revelação, Claire se despede da professora para sempre e finalmente desaparece.
Dias depois, Luke se muda porque o negócio de seu pai exige. Após um período de tempo sem definir o professor recebe uma carta dele contando que algo estranho aconteceu…
